智能馬桶一體機從外觀上與智能馬桶蓋的區別是智能馬桶一體機看起來更簡潔，線條更漂亮，與陶瓷的連結嚴絲合縫，且智能馬桶的上蓋只能配這個型號專用的陶瓷體，但智能馬桶蓋可以配很多的陶瓷體，且智能馬桶蓋和普通馬桶的安裝看起來也不是非常貼合，美觀度不如智能馬桶一體機。
兩者從功能數量上來區別，智能馬桶一體機的功能要更多，比如自動翻蓋，自動翻圈，自動沖水功能。
智能馬桶蓋卻沒有，尤其是沒有自動沖水功能。
從價格上來區分，智能一體機的價格更高，一般來說，智能馬桶一體機的價格是智能馬桶蓋的2-8倍。
從安裝方式上區分，智能馬桶蓋的安裝更簡單一些，自己動手都可以實現安裝。 但智能馬桶一體機的安裝需要專業一點的師傅裝，否則會出現馬桶安裝後反臭漏水的問題。
從重量上來區分，智能馬桶一體機的重量在50kg左右，智能馬桶蓋的重量在10kg左右。